Philipp Christen  .  Rolf Jaussi .  Roger Benoit

Biochemie und Molekularbiologie

Eine Einführung mit 40 Lerneinheiten




26   Stoffaustausch durch Membranen


Inhaltsverzeichnis

Einführung Website

Merksätze

Kontrollfragen

26.1 Grundsätzliches zum Membrantransport

26.2 Mechanismus der Na+/K+-Pumpe

26.3 Symport- und Antiport-Systeme

26.4 Passiver Transport, erleichterte Diffusion

26.5 Ionenkanäle, chemisches und elektrisches Membranpotenzial

26.6 Transzellulärer Transport

Weiterführende Literatur



Links

26.1 Grundsätzliches zum Membrantransport

Transporter classification database (www.tcdb.org, Saier Lab): Datenbank zur Einordnung von Transportern

Structure-function studies of the cytochrome b6f complex (Cramer Lab, www.bio.purdue.edu): Studien zur Struktur und Funktion des Cytochrme b6f Komplex

Photosystem II (David S. Goodsell, RCSB PDB): Struktur und Funktion

Cellular transport (www.wiley.com, Interactive Concepts in Biochemistry): Animation zu unterschiedlichen Mechanismen des Membrantransports

26.2 Mechanismus der Na+/K+-Pumpe

How the sodium-potassium pump Works (McKinley, O'Loughing, Human anatomy, McGraw Hill): Animation zur Na+/K+-Pumpe

Sodium-potassium pump (David S. Goodsell, RCSB PDB): Struktur und Funktion der Na+/K+-Pumpe

Natrium-Kalium-Pumpe (Wikipedia)

26.3 Symport- und Antiport-Systeme

Membrantransport (Wikipedia)

A two-domain elevator mechanism for sodium/proton antiport (Lee et al 2013, Nature 501, 573-577): Videos zu den Konformationen des Natrium/Proton-Antiporters

X-ray structures of LeuT in substrate-free outward-open and apo inward-open states, supplementary movie (Krishnamurthy and Gouaux 2012, Nature 481, 469-474): Simulation der Öffnung und Schliessung des LeuT-Transporters

26.4 Passiver Transport, erleichterte Diffusion

Function and structure of OmpF porin (www.bio.davidson.edu): Funktion und Struktur des Porins OmpF

Bacterial porin simulation (VPAC, eresearchvictoria, YouTube): Simulation eines bakteriellen Porins in der Membran

Structure of porin refined at 1.8 Å resolution (Weiss and Schulz 1992, J Mol Biol 227, 493-509; RCSB PDB): 3D-Struktur eines Porin-Trimers

Ionophore (Wikipedia): Ionophoren

Ionophores (www.reference.md): Liste von Ionophoren

Structure, dynamics, and function of aquaporins (Theoretical and computational biophysics group, University of Illinois at Urbana-Champaign): Übersicht zur Struktur, Funktion und Dynamik der Aquaporine mit Animation (Eines der Wassermoleküle ist gelb markiert. Es durchquert die Membran in 12 ns; d.h. pro Sekunde passieren 108 H2O-Moleküle den Kanal.)

Water channels in cell membranes (Nobelprize.org): Detaillierte Dynamik aller Moleküle einer Membran mit Aquaporin

26.5 Ionenkanäle, chemisches und elektrisches Membranpotenzial

Ion channel (Scitable, Nature Education): Ionenkanäle

Ion channel (euplotes, YouTube): Animation zur Struktur eines Kalium-Ionenkanals

Calcium pump (David S. Goodsell, RCSB PDB): Struktur und Funktion

Potassium channels (David S. Goodsell, RCSB PDB): Struktur und Funktion

26.6 Transzellulärer Transport

The vesiculo-vacuolar organelle (VVO): A new endothelial cell permeability organelle, Figures (Dvorak and Feng 2001, J Histochem Cytochem 49, 419-431): EM-Bilder von vesikulo-vaskulären Organellen


Weiterführende Literatur

Tempelaars et al 2011, Appl Environ Microbiol - "Comparative analysis of antimicrobial activities of valinomycin and cereulide, the Bacillus cereus emetic toxin"

Ashcroft et al 2009, Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci - "Introduction. The blurred boundary between channels and transporters"

Karlish et al. 2008, Weizmann Institute of Science - "The sodium-potassium pump: structure, function, regulation and pharmacology" (Direct link)

Kanai et al. 2014, Nature - "Crystal structure of a Na+-bound Na+, K+-ATPase preceding the E1P state"

Nyblom et al. 2013, Science - "Crystal structure of Na+, K(+)-ATPase in the Na(+)-bound state"

Morth et al. 2007, Nature - "Crystal structure of the sodium-potassium pump"

Zhou et al. 2014, Nature - "Structural basis of the alternating-access mechanism in a bile acid transporter"

Lee et al 2013, Nature - "A two-domain elevator mechanism for sodium/proton antiport"

Pedersen 2007, Nature - "Crystal structure of the plasma membrane proton pump"

Shimamura et al. 2010, Science - "Molecular basis of alternating access membrane transport by the sodium-hydantoin transporter Mhp1"

Krishnamurthy and Gouaux 2012, Nature - "X-ray structures of LeuT in substrate-free outward-open and apo inward-open states"

Nikaido 2003, Microbiol Mol Biol Rev - "Molecular basis of bacterial outer membrane permeability revisited"

Dvorak et al. 1996, J Leukoc Biol - "The vesiculo-vacuolar organelle (VVO): a distinct endothelial cell structure that provides a transcellular pathway for macromolecular extravasation"

Fischbarg 2010, Physiol Rev - "Fluid transport across leaky epithelia: central role of the tight junction and supporting role of aquaporins"


Revision Oktober 2018