Philipp Christen  .  Rolf Jaussi .  Roger Benoit

Biochemie und Molekularbiologie

Eine Einführung mit 40 Lerneinheiten




3   Raumstruktur der Proteine


Inhaltsverzeichnis

Einführung Website

Merksätze

Kontrollfragen

3.1 Stabilisierung der Raumstruktur

3.2 Sekundärstruktur

3.3 Tertiärstruktur

3.4 Äußere Gestalt und Quartärstruktur

3.5 Dynamik und funktionsgebundene Strukturänderungen

3.6 Denaturierung

3.7 Faltungswege

3.8 Proteinfehlfaltung

3.9 Faserproteine

Weiterführende Literatur



Links

3.1 Stabilisierung der Raumstruktur

Protein structure animation (YouTube): Kurze Animation über die Hierarchie der Proteinfaltung mit Erklärungen

Protein folding animation (YouTube): Kurze Animation über Proteinfaltung

Introduction to protein structure (learner.org): Übersicht zu Proteinstruktur und experimentellen Methoden zur Strukturlösung

Protein interactions leading to folding (uoguelph.ca): Artikel über Wechselwirkungen, welche zur Proteinfaltung beitragen

General principles of membrane protein folding and stability (Stephen White laboratory): Kurze Übersicht zur Faltung von Membranproteinen

To online macromolecular museum (Callutheran.edu): Sammlung von wichtigen Proteinstrukturen mit 3D Ansichten und Erklärungen

3.2 Sekundärstruktur

Secondary structure (YouTube): Animation zur Sekundärstruktur

3.3 Tertiärstruktur

Tertiary structure (YouTube): Animation zur Tertiärstruktur

Foldit - online protein-folding game

3.4 Äußere Gestalt und Quartärstruktur

Quaternary structure (YouTube): Animation zur Quartärstruktur

Protein structure (YouTube - University of Surrey): Animation zur Proteinstruktur

3.5 Dynamik und funktionsgebundene Strukturänderungen

Hemoglobin: Studying the T to R transition (Janet Iwasa): Animationen zu Strukturänderungen von Hämoglobin

Protein folding Animation (YouTube): Animation zur Dynamik der Proteinfaltung

Folding and binding of an intrinsically disordered protein (Bio Comp Pictures, YouTube, J. Chemical Theory and Computation): Animation

3.6 Denaturierung

Protein denaturation (YouTube): Animation einer Protein-Denaturierung

3.7 Faltungswege

Protein folding (YouTube): Kurze Animation zur Energie-Minimierung bei der Proteinfaltung

Protein folding/stability in vivo and in vitro (Biochemistry Online, Dr. H. Jakubowski): Ausführliche Zusammenfassung der kinetischen und thermodynamischen Aspekte der Proteinfaltung

Chaperones (David S. Goodsell, RCSB PDB): Übersicht zu Struktur und Funktionen von Chaperonen

Heat shock protein information resource (http://pdslab.biochem.iisc.ernet.in/hspir): Hitzeschockproteine

3.8 Proteinfehlfaltung

Prions (David S. Goodsell, RCSB PDB): Übersicht zu Prionen: Proteine, die in falsch gefalteter Form Krankheiten verursachen können

Human prion protein fragment (PDB): 3-D Struktur eines Fragments eines Prionen Proteins

Stanley B. Prusiner (Nobelprize.org): Kurze Autobiografie des Entdeckers der Prionen

Marfan-Syndrom (Doccheck Flexikon)

3.9 Faserproteine

Low resolution molecular envelope structure of type I collagen (PDB): 3D Struktur von Kollagen

Collagen (David S. Goodsell, RCSB PDB): Übersicht zu Kollagen Funktionen und Struktur

Das Strukturprotein Keratin (Chemgapedia)

Desmosin-Struktur

Dauerwellen


Weiterführende Literatur

Kolodny et al. 2013, Annu Rev Biophys - "On the universe of protein folds"

Moore et al. 2008, Trends Biochem Sci - "Arrangements in the modular evolution of proteins"

Han et al. 2007, Nat Rev Mol Cell Biol - "The folding and evolution of multidomain proteins"

Trifonov and Frenkel 2009, Curr Opin Struct Biol. - "Evolution of protein modularity"

Finkelstein et al. 2016, Nature - "The protein world"

Changeux and Edelstein 2011, F1000 Biology Reports - "Conformational selection or induced fit? 50 years of debate resolved"

Sugase et al. 2007, Nature - "Mechanism of coupled folding and binding of an intrinsically disordered protein"

Chiti and Dobson 2006, Annu Rev Biochem - "Protein misfolding, functional amyloid, and human disease"

Cabrita et al. 2010, Curr Opin Struct Biol - "Protein folding on the ribosome"

Burgess and Zhang 2013, Nat Struct Mol Biol - "Histone chaperones in nucleosome assembly and human disease"

Gupta and Tuteja 2011, Plant Signal Behav - "Chaperones and foldases in endoplasmic reticulum stress signaling in plants"

Rothman and Schekman 2011, Cell - "Molecular mechanism of protein folding in the cell"

Rocklin et al. 2017, Science - "Global analysis of protein folding using massively parallel design, synthesis, and testing"

San Martin 2012, Viruses - "Latest insights on adenovirus structure and assembly"

Mashaghi et al. 2016, Nature - "Alternative modes of client binding enable functional plasticity of Hsp70"

Liu and Craig 2016, Nature - "Molecular biology: Mature proteins braced by a chaperone"

Anderson et al. 2016, Nature - "Transcription of the non-coding RNA upperhand controls Hand2 expression and heart development"

Tycko 2016, Nature - "Alzheimer's disease: Structure of aggregates revealed"

Kueffer et al. 2016, Nature - "The prion protein is an agonistic ligand of the G protein-coupled receptor Adgrg6"

Nature Insight Neurogenerative Diseases 2016

Sevigny et al. 2016, Nature - "The antibody aducanumab reduces Aβ plaques in Alzheimer's disease"


Revision März 2019