biplex

Hilfe

Index

Datenbanken

<    >

biplex schliessen

Protein-3D-Modelle

Albumin 0.8 MB
Aldolase 0.2 MB
Bakterielle Alkoholdehydrogenase 0.9 MB
Pferdeleber-Alkoholdehydrogenase 0.6 MB
Humane sigma Alkoholdehydrogenase 0.9 MB
Humane beta 3 Alkoholdehydrogenase 0.5 MB
Alkalische Phosphatase 0.5 MB
Amylase 0.4 MB
Antikörper 1.0 MB
Cholesterinoxidase 0.3 MB
Chymotrypsin 0.1 MB
Chymotrypsinogen 0.2 MB
Coerulosplasmin 0.7 MB
Cytochrom c 0.2 MB
Cytochromoxidase 2.7 MB
Enolase 0.6 MB
Ferritin 2.7 MB
GAPDH 1.3 MB
Glucoseoxidase 0.4 MB
Glutathionperoxidase 0.3 MB
Hämoglobin 0.8 MB
Hexokinase 0.6 MB
Katalase 1.4 MB
Lactamase 0.2 MB
Lactat-Dehydrogenase (HH) 0.5 MB
Lactat-Dehydrogenase (MM) 1.7 MB
Pankreaslipase 0.6 MB
Pepsin 0.3 MB
Pepsinogen 0.5 MB
Peroxidase 0.5 MB
Phosphoglyceratkinase 0.3 MB
Phosphoglyceratmutase 0.2 MB
Pyruvatkinase 1.1 MB
Restriktionsendonuclease Bam HI 0.4 MB
Restriktionsendonuclease EcoR V 0.4 MB
Restriktionsendonuclease Pvu II 0.3 MB
Taq-DNA-Polymerase 0.4 MB
Transferrin 0.5 MB
Triosephosphat-Isomerase 0.3 MB
Trypsin 0.2 MB

Da die Dateien mit Strukturinformationen für Makromoleküle manchmal gross sind, werden Sie erst auf Verlangen auf Ihren Computer geladen. Sie finden 3D Molekülmodelle zu Proteinen, indem Sie beim Eintrag des entsprechenden Proteins auf die Abbildung dieses Proteins klicken oder aus der untenstehenden Liste aussuchen. Diese Molekülmodelle können Sie mit den JMol Knöpfen unterschiedlich darstellen.

Die ursprüngliche Darstellung können Sie durch neues Laden der Seite im Browser darstellen (reload).

Farbe
nach Atomtyp
nach Peptidkette
nach Sekundärstruktur
nach Hydrophobizität

• Mit der Farbgebung nach Atomtyp werden die einzelnen Atome des Proteins nach der Farbkodierung wie oben dargestellt. Es lassen sich so Schwefel- oder Metallatome leichter unterscheiden.
• Bei Proteinen mit mehreren Untereinheiten lassen sich diese unterschiedlich, "nach Peptidkette" anfärben.
• Nach "Sekundärstruktur" angefärbt sind alpha-Helices pink, beta-Faltblatt-Stukturen gelborange und random-coil-Strukturen weiss angefärbt.
• Hydrophile Bereiche des Proteins werden blau markiert, hydrophobe grün.

Bewegung
aus
ein

• Falls Ihr Compute Mühe mit den Modellen hat, schalten Sie die Bewegung aus, z.B. zum Drucken oder Runterscrollen.
• Bewegen Sie das Molekül indem sie mit der Maus darüber fahren oder setzen Sie es in Rotation mit der "ein"-Taste

Darstellung der Peptidketten
Raumfüllend
Drahtmodell
Peptidkette
Bänder

• Raumfüllende Darstellung der Peptidketten nach Untereinheiten gefärbt.
• Das Drahtmodell erlaubt es, in das Molekül hineinzusehen und die Lage von Substraten oder Coenzymen sichtbar zu machen.
• Lässt man die Aminosäurereste weg, so zeigt sich der Verlauf des "Rückgrates" der Peptidkette.
• Dieses lässt sich etwas anschaulicher auch als "Bänder" darstellen.
• "Farbbänder" zeigen das Protein in den Regenbogenfarben von N-term nach C-term.

Bestandteile des Proteins
Gesamtprotein
Peptidketten
als Bänder
Nichtproteinbestandteile
mit Peptidkette

• Gesamtprotein zeigt die Peptidketten zusammen mit den Heteroatomen.
• "Peptidketten" zeigt nur Proteinbestandteile, ohne Liganden etc.
• Sie können die "Nichtproteinbestandteile" separat sichtbar machen...
• und diese zusammen mit der "Peptidkette" betrachten.