Philipp Christen  .  Rolf Jaussi .  Roger Benoit

Biochemie und Molekularbiologie

Eine Einführung mit 40 Lerneinheiten




3   Raumstruktur der Proteine


Inhaltsverzeichnis

Einführung Website

Merksätze

Kontrollfragen

3.1 Stabilisierung der Raumstruktur

3.2 Sekundärstruktur

3.3 Tertiärstruktur

3.4 Äußere Gestalt und Quartärstruktur

3.5 Dynamik und funktionsgebundene Strukturänderungen

3.6 Denaturierung

3.7 Faltungswege

3.8 Proteinfehlfaltung

3.9 Faserproteine

Weiterführende Literatur



Links

3.1 Stabilisierung der Raumstruktur

Protein structure animation (YouTube): Kurze Animation über die Hierarchie der Proteinfaltung mit Erklärungen

Protein folding animation (YouTube): Kurze Animation über Proteinfaltung

Protein structure (Scitable, Nature Education)

General principles of membrane protein folding and stability (Stephen White laboratory): Kurze Übersicht zur Faltung von Membranproteinen

To online macromolecular museum (Callutheran.edu): Sammlung von wichtigen Proteinstrukturen mit 3D Ansichten und Erklärungen

3.2 Sekundärstruktur

Secondary structure (YouTube): Animation zur Sekundärstruktur

3.3 Tertiärstruktur

Tertiary structure (YouTube): Animation zur Tertiärstruktur

3.4 Äußere Gestalt und Quartärstruktur

Quaternary structure (YouTube): Animation zur Quartärstruktur

Protein structure (YouTube - University of Surrey): Animation zur Proteinstruktur

3.5 Dynamik und funktionsgebundene Strukturänderungen

Hemoglobin: Studying the T to R transition (Janet Iwasa): Animationen zu Strukturänderungen von Hämoglobin

Protein folding Animation (YouTube): Animation zur Dynamik der Proteinfaltung

Folding and binding of an intrinsically disordered protein (Bio Comp Pictures, YouTube, J. Chemical Theory and Computation): Animation

3.6 Denaturierung

Protein denaturation (YouTube): Animation einer Protein-Denaturierung

3.7 Faltungswege

Protein folding (YouTube): Kurze Animation zur Energie-Minimierung bei der Proteinfaltung

Protein folding/stability in vivo and in vitro (Biochemistry Online, Dr. H. Jakubowski): Ausführliche Zusammenfassung der kinetischen und thermodynamischen Aspekte der Proteinfaltung

Chaperones (David S. Goodsell, RCSB PDB): Übersicht zu Struktur und Funktionen von Chaperonen

Heat shock protein information resource (http://pdslab.biochem.iisc.ernet.in/hspir): Hitzeschockproteine

3.8 Proteinfehlfaltung

Prions (David S. Goodsell, RCSB PDB): Übersicht zu Prionen: Proteine, die in falsch gefalteter Form Krankheiten verursachen können

Amyloids (David S. Goodsell, RCSB PDB)

Human prion protein fragment (PDB): 3-D Struktur eines Fragments eines Prionen Proteins

Stanley B. Prusiner (Nobelprize.org): Kurze Autobiografie des Entdeckers der Prionen

Marfan-Syndrom (Doccheck Flexikon)

3.9 Faserproteine

Low resolution molecular envelope structure of type I collagen (PDB): 3D Struktur von Kollagen

Collagen (David S. Goodsell, RCSB PDB): Übersicht zu Kollagen Funktionen und Struktur

Desmosin-Struktur

Dauerwellen


Weiterführende Literatur

Anishchenko et al. 2021, Nature - "De novo protein design by deep network hallucination"

Eisenstein 2021, Nature - "Artificial intelligence powers protein-folding predictions"

Service 2021, Science - "Protein structures for all"

Sugase et al. 2007, Nature - "Mechanism of coupled folding and binding of an intrinsically disordered protein"

Chiti and Dobson 2006, Annu Rev Biochem - "Protein misfolding, functional amyloid, and human disease"

Cabrita et al. 2010, Curr Opin Struct Biol - "Protein folding on the ribosome"

Burgess and Zhang 2013, Nat Struct Mol Biol - "Histone chaperones in nucleosome assembly and human disease"

Gupta and Tuteja 2011, Plant Signal Behav - "Chaperones and foldases in endoplasmic reticulum stress signaling in plants"

Rothman and Schekman 2011, Cell - "Molecular mechanism of protein folding in the cell"

San Martin 2012, Viruses - "Latest insights on adenovirus structure and assembly"

Mashaghi et al. 2016, Nature - "Alternative modes of client binding enable functional plasticity of Hsp70"

Liu and Craig 2016, Nature - "Molecular biology: Mature proteins braced by a chaperone"

Anderson et al. 2016, Nature - "Transcription of the non-coding RNA upperhand controls Hand2 expression and heart development"

Korte 2019, Science - "Neuronal function of Alzheimer's protein"

Kueffer et al. 2016, Nature - "The prion protein is an agonistic ligand of the G protein-coupled receptor Adgrg6"

Focus on neurodegenerative diseases, Nature Neuroscience 2018

Sevigny et al. 2016, Nature - "The antibody aducanumab reduces Aβ plaques in Alzheimer's disease"


Revision Mai 2024