Biochemie und Molekularbiologie

38   Proteinanalytik

Inhaltsverzeichnis

Einführung Website

Merksätze

Kontrollfragen

38.1 Bestimmung der Aminosäurezusammensetzung und Sequenzanalyse von Proteinen

38.2 Analyse der 3D-Struktur von Makromolekülen durch Röntgenkristallographie

38.3 Analyse der 3D-Struktur von Makromolekülen durch magnetische Kernresonanz (NMR)

38.4 Elektronenmikroskopie

38.5 Untersuchung posttranslationaler Modifikationen von Proteinen

38.6 Untersuchung von Protein-Ligand-Wechselwirkungen

Weiterführende Literatur

Links

Sequence determination one terminal unit at a time (M. Evans, YouTube): Kurze Vorlesung zum Edman-Abbau Edman-Abbau (Lexikon der Biochemie, www.spektrum.de) Proteomics (Nat Biotechnol 2000, 18, IT45-46) Peptide de novo sequencing (www.bioinfor.com): Erklärung des de novo Sequenzierens mit Peptiden Protein analytical services (Peter Hunziker, fgcz-intranet.uzh.ch): Übersicht zur Proteinanalyse durch Massenspektrometrie und Aminosäuren-Analyse (Functional Genomics Center Zürich)

38.2 Analyse der 3D-Struktur von Makromolekülen durch Röntgenkristallographie

Methods for determining atomic structures (RCSB PDB): Methoden zur Strukturlösung Protein crystallography at the John Innes Centre (John Innes Centre, YouTube): Kurze Übersicht der Röntgenkristallographie Cracking the phase problem (Nobelprize.org): Artikel zur Lösung des Phasen-Problems für die Proteinkristallographie Protein crystallography course (R.J. Read; Structural Medicine, www-strucmed.cimr.cam.ac.uk): Röntgenkristallographie-Vorlesungsreihe Nobel prize winners associated with crystallography (www.iucr.org, International Union of Crystallography): Nobelpreise im Zusammenhang mit Röntgenkristallographie Swiss Light Source (Paul Scherrer Institut, www.psi.ch): Synchrotron Lichtquelle Schweiz (SLS) Die Synchrotron Lichtquelle Schweiz SLS (Paul Scherrer Institut, www.psi.ch) Überblick: SwissFEL (Paul Scherrer Institut, www.psi.ch) Swiss Light Source SLS (Paul Scherrer Institut): Film zur Synchrotron Lichtquelle Schweiz SLS Lysozyme crystal growth (sblnewcastle, YouTube): Kurzer Zeitraffer-Film zum Wachstum von Proteinkristallen in einem Tropfen Mosquito for protein crystallography (www.labtube.tv): Video zum Mosquito, einem Roboter zur Proteinkristallisierung

38.3 Analyse der 3D-Struktur von Makromolekülen durch magnetische Kernresonanz (NMR)

Structure determination of proteins with NMR spectroscopy (H.J. Schirra, ww.cryst.bbk.ac.uk): Detaillierte Erklärung der Protein-NMR Nuclear magnetic resonance Fourier transform spectroscopy (Nobelprize.org): Nobel-Vorlesung von Richard R. Ernst NMR studies of structure and function of biological macromolecules (Nobelprize.org): Nobel-Vorlesung von Kurt Wüthrich The Nobel Prize in chemistry 2013, Karplus, Levitt and Warshel (Nobelprize.org)

38.4 Elektronenmikroskopie

Abbildung eines Transmissionselektronenmikroskops (H. Jastrow, EM Atlas) Ernst Ruska - Facts (Nobelprize.org): 1986 Nobelpreis in Physik für fundamentale Arbeit in Elektronenoptik und für den Entwurf des ersten Elektronenmikroskops Beispiel einer Proteinkomplex-Struktur, die durch die Kombination von 3D-EM und Röntgenkristallographie ermittelt wurde (Lee et al. 2013, PLoS Pathog 9, e1003690, Figure 1) Secrets of a cellular machine (P. Preuss, Science@berkeley lab, www2.lbl.gov): Cryo-EM-Tomographie-Strukturen von Flagella und Cilia Richard Henderson, MRC (www2.mrc-lmb.cam.ac.uk): Webpage von Richard Henderson, einem Pionier der Elektronenkristallographie Model for the structure of bacteriorhodopsin based on high-resolution electron cryo-microscopy (Henderson et al. 1990, J Mol Biol 213, 899-929, RCSB PDB): Erste 3D-Struktur, die durch Elektronenkristallographie gelöst wurde EMDataBank (www.emdatabank.org): Datenbank der EM-Strukturen Electron crystallography (Wikipedia) Kryoelektronentomographie (Wikipedia)

38.5 Untersuchung posttranslationaler Modifikationen von Proteinen

	Cellular post-translational modifications (Jensen 2006, Nat Rev Mol Cell Biol 7, 392, Nature Education 1(3):6): Übersicht zu posttranslationalen Modifikationen Overview of post-translational modifications (Thermo Scientific, www.piercenet.com): Übersicht der posttranslationalen Modifikationen und deren experimentelle Untersuchung

38.6 Untersuchung von Protein-Ligand-Wechselwirkungen

Fluorescence resonance energy transfer (UC Davis ChemWiki; chemwiki.ucdavis.edu): Übersicht zum Förster-Resonanzenergietransfer (FRET) Fundamental Principles of Förster Resonance Energy Transfer (FRET) Microscopy with Fluorescent Proteins (www.microscopyu.com): Übersicht zur FRET-Mikroskopie Oberflächenplasmonenresonanzspektroskopie (Wikipedia): Kurze Übersicht zur "Surface Plasmon Resonance Spectroscopy SPR"

Weiterführende Literatur